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昨晚最新发布西湖大学在新冠病毒研讨方面又有重要发现

2020-04-08 10:26:34  阅读:2752 作者:责任编辑NO。邓安翔0215 浏览次数:2752

继周强实验室之后,西湖大学生命科学学院PI(研讨员)郭天南带领的蛋白质组大数据实验室,近来在新冠病毒研讨方面又有重要发现。

他们和协作团队一同对新冠肺炎患者血液中的蛋白质和代谢物分子进行体系检测,发现重症患者的血清中存在多种共同的分子改动,并找到了一系列生物标志物,有望为猜测轻症患者向重症开展供给导向。

相关研讨成果,已于北京时间4月8日0时15分,在预印版渠道medRxiv上线。

新冠肺炎疫情已在全球范围内敏捷延伸,感染人数超越百万。但是,咱们只看到临床症状和印象学特征,对疾病在微观分子层面的改动知之甚少。咱们至今仍不清楚新冠病毒感染对患者有什么影响,也不太清楚在临床医治中,为什么有些轻症患者会在短时间内敏捷演变为重症。

郭天南团队与临床、代谢组研讨团队协作,对99份病毒灭活处理的血清样本进行了安全处理和质谱剖析。依据现行临床确诊规范,这些血样被分为对照(健康)组、疑似但实为一般流感组、新冠感染轻症组、新冠感染重症组。团队成员运用高分辨率质谱设备取得了样本的蛋白质组和代谢组谱图,对血清样本中的蛋白和代谢物的相对浓度进行了全景式的测定,然后提醒了重症患者体内多种共同的分子调控。

实验设计及流程

与对照(健康)组、一般流感组和轻症组比较,新冠肺炎重症患者的样本中呈现了93种特有的蛋白表达和204个特征性改动的代谢分子。其间50种蛋白,与患者体内的巨噬细胞、补体体系、血小板脱颗粒有关。

研讨团队还发现,在新冠病毒感染的重症患者体内,有100多种氨基酸及100多种脂质均呈现明显削减。这可能是病毒敏捷扩增导致的耗费,为临床医师监控病况和拟定调整医治计划供给了必定的参阅。

COVID-19感染后依据组学数据估测的重症患者体内的巨噬细胞、血小板、补体体系的作用通路图。这些蛋白质和代谢物有望成为提早确诊重症患者的生物符号物和医治的靶点。

此外,郭天南团队在质谱剖析数据的基础上,运用机器学习办法进一步“去粗取精”,挑选出重症患者特征性的22个蛋白质和7个代谢物。血清样本成分契合这一组合的患者,很可能是重症患者,或有很大可能性开展为重症病例。这一发现有望用于重症患者的猜测,促进医疗资源的合理分配,并为重症患者的药物挑选供给必定辅导。当然,该成果还需要在更多的独立临床行列中验证。

蛋白质表达是临床确诊的重要依据,疾病医治的作用也取决于蛋白质机器的调控。郭天南团队和协作团队一同从本年2月底发动研讨,他们选用新的质谱检测技能和机器学习的办法,短时间内整合蛋白质组、临床、生物、代谢组、核算等多学科数据,重复挑选、剖析、比对、验证,首先完成了COVID-19轻重症患者的血清蛋白质组与代谢组剖析,为新冠重症患者血清中发作的、共同的、现在尚不清晰的分子病理改动供给了一个全景式的描绘。

蛋白质组大数据实验室

下一步,该实验室将持续运用多学科穿插与蛋白质组技能对新冠病毒感染进行深入研讨,以期取得更多有助于了解病况开展规律的发现,辅佐已有的检测、确诊手法,完成更精准、高效的医治。

本项研讨得到温州医科大学隶属浙江省台州医院和迪安确诊凯莱谱代谢组学实验室的大力支持。腾讯基金会亦对本项目进行了赞助。

记者 刘云

修改 申佩琦

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